Zwei Tagebücher dieses bedeutenden Wissenschaftlers befinden sich im im Archiv für Wissenschaftsgeschichte: http://objekte.nhm-wien.ac.at/objekt/th337/ob2043.
Mit Budgetmitteln der FREUNDE des NHM Wien konnte im Jahr 2020 die Transkription der Tagebücher Ferdinand von Hochtstetters finanziert werden.