Ein einzigartiges wissenschaftliches Projekt zur Erforschung der Geschichte rund um den prähistorischen Salzbergbau in Hallstatt wurde 2012 in Angriff genommen und von den FREUNDEN des NHM Wien finanziell unterstützt: In der Mitte des Hallstätter Sees wurden in einer Wassertiefe von rund 100 Metern an vier Stellen Bohrkerne aus dem Seeboden entnommen. Die Seesedimente sollen Auskunft über die Umweltbedingungen rund um die Hallstätter Salzbergwerke während der letzten Jahrtausende geben. Die Bohrkerne werden vom Geoforschungszentrum Potsdam und vom NHM gemeinsam ausgewertet.